As bactérias se dividem em heterotróficas, onde não
conseguem produzir seu própio alimento, e autotróficas, produzindo seu próprio
alimento.
As heterotróficas alimentam-se principalmente da matéria
orgânica que conseguem decompondo organismos mortos, são as decompositoras ou
também chamadas de saprófitas.As decompositoras ajudam na reciclagem da matéria na natureza transformando matéria orgânica dos organismos mortos em matéria inorgânica, como os sais minerais que são liberados e podem ser utilizados por alguma planta.
Existem também outros dois tipos de bactérias, as parasitas e as que possuem uma relação de mutualismo com outros seres vivos, onde as parasitas se alimentam de subtâncias retiradas de outros seres vivos, causando-lhes doença.E há as que possuem a relação de mutualismo, onde ambos os seres são beneficiados, como no caso das raízes do feijão, por exemplo, as bactérias fixam o nitrogênio do ar, transformando-os em nitrato.O feijoeiro então utiliza parte do nitrato que auxilia seu desenvolvimento que por sua vez cede para as bactérias parte do alimento que fabrica através da fotossíntese.
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